Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trip10Q8CJ53 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trip10Q8CJ53 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trip10Q8CJ53 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trip10Q8CJ53 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trip10Q8CJ53 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trip10Q8CJ53 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trip10Q8CJ53 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trip10Q8CJ53 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trip10Q8CJ53 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trip10Q8CJ53 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trip10Q8CJ53 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trip10Q8CJ53 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trip10Q8CJ53 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trip10Q8CJ53 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trip10Q8CJ53 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trip10Q8CJ53 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trip10Q8CJ53 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trip10Q8CJ53 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trip10Q8CJ53 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trip10Q8CJ53 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trip10Q8CJ53 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trip10Q8CJ53 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trip10Q8CJ53 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trip10Q8CJ53 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip10Q8CJ53 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms