Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nup88Q8CEC0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup88Q8CEC0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup88Q8CEC0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup88Q8CEC0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup88Q8CEC0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup88Q8CEC0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup88Q8CEC0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup88Q8CEC0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup88Q8CEC0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup88Q8CEC0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup88Q8CEC0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup88Q8CEC0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup88Q8CEC0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup88Q8CEC0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup88Q8CEC0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup88Q8CEC0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup88Q8CEC0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup88Q8CEC0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup88Q8CEC0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup88Q8CEC0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup88Q8CEC0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup88Q8CEC0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup88Q8CEC0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup88Q8CEC0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup88Q8CEC0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup88Q8CEC0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup88Q8CEC0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup88Q8CEC0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup88Q8CEC0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup88Q8CEC0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup88Q8CEC0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup88Q8CEC0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup88Q8CEC0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup88Q8CEC0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup88Q8CEC0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup88Q8CEC0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup88Q8CEC0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup88Q8CEC0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup88Q8CEC0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup88Q8CEC0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup88Q8CEC0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup88Q8CEC0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup88Q8CEC0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup88Q8CEC0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup88Q8CEC0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup88Q8CEC0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup88Q8CEC0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup88Q8CEC0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup88Q8CEC0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup88Q8CEC0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup88Q8CEC0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Nup88Q8CEC0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nup88Q8CEC0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nup88Q8CEC0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nup88Q8CEC0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nup88Q8CEC0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nup88Q8CEC0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup88Q8CEC0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup88Q8CEC0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup88Q8CEC0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup88Q8CEC0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup88Q8CEC0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup88Q8CEC0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup88Q8CEC0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup88Q8CEC0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup88Q8CEC0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup88Q8CEC0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup88Q8CEC0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup88Q8CEC0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup88Q8CEC0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup88Q8CEC0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup88Q8CEC0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup88Q8CEC0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup88Q8CEC0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup88Q8CEC0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup88Q8CEC0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup88Q8CEC0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nup88Q8CEC0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms