Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc17Q8CE13 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc17Q8CE13 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc17Q8CE13 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc17Q8CE13 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc17Q8CE13 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc17Q8CE13 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc17Q8CE13 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc17Q8CE13 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc17Q8CE13 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc17Q8CE13 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc17Q8CE13 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc17Q8CE13 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc17Q8CE13 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc17Q8CE13 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc17Q8CE13 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc17Q8CE13 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc17Q8CE13 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc17Q8CE13 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc17Q8CE13 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc17Q8CE13 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc17Q8CE13 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc17Q8CE13 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc17Q8CE13 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc17Q8CE13 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc17Q8CE13 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc17Q8CE13 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc17Q8CE13 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc17Q8CE13 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc17Q8CE13 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc17Q8CE13 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc17Q8CE13 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc17Q8CE13 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc17Q8CE13 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc17Q8CE13 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc17Q8CE13 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc17Q8CE13 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc17Q8CE13 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc17Q8CE13 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc17Q8CE13 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc17Q8CE13 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc17Q8CE13 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc17Q8CE13 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc17Q8CE13 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc17Q8CE13 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms