Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc178Q8CDV0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc178Q8CDV0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc178Q8CDV0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc178Q8CDV0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc178Q8CDV0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc178Q8CDV0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc178Q8CDV0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc178Q8CDV0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc178Q8CDV0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc178Q8CDV0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc178Q8CDV0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc178Q8CDV0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc178Q8CDV0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc178Q8CDV0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc178Q8CDV0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc178Q8CDV0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc178Q8CDV0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc178Q8CDV0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc178Q8CDV0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc178Q8CDV0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc178Q8CDV0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc178Q8CDV0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc178Q8CDV0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc178Q8CDV0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc178Q8CDV0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc178Q8CDV0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc178Q8CDV0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc178Q8CDV0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc178Q8CDV0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc178Q8CDV0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc178Q8CDV0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc178Q8CDV0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc178Q8CDV0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc178Q8CDV0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc178Q8CDV0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc178Q8CDV0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc178Q8CDV0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc178Q8CDV0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc178Q8CDV0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc178Q8CDV0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc178Q8CDV0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc178Q8CDV0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc178Q8CDV0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc178Q8CDV0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc178Q8CDV0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc178Q8CDV0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms