Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ufl1Q8CCJ3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ufl1Q8CCJ3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ufl1Q8CCJ3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ufl1Q8CCJ3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ufl1Q8CCJ3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ufl1Q8CCJ3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ufl1Q8CCJ3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ufl1Q8CCJ3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ufl1Q8CCJ3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ufl1Q8CCJ3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ufl1Q8CCJ3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ufl1Q8CCJ3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ufl1Q8CCJ3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ufl1Q8CCJ3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ufl1Q8CCJ3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ufl1Q8CCJ3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ufl1Q8CCJ3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ufl1Q8CCJ3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ufl1Q8CCJ3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ufl1Q8CCJ3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ufl1Q8CCJ3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ufl1Q8CCJ3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ufl1Q8CCJ3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ufl1Q8CCJ3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ufl1Q8CCJ3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ufl1Q8CCJ3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ufl1Q8CCJ3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ufl1Q8CCJ3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ufl1Q8CCJ3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ufl1Q8CCJ3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ufl1Q8CCJ3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ufl1Q8CCJ3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ufl1Q8CCJ3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ufl1Q8CCJ3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ufl1Q8CCJ3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ufl1Q8CCJ3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ufl1Q8CCJ3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ufl1Q8CCJ3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ufl1Q8CCJ3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ufl1Q8CCJ3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ufl1Q8CCJ3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ufl1Q8CCJ3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ufl1Q8CCJ3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ufl1Q8CCJ3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ufl1Q8CCJ3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ufl1Q8CCJ3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ufl1Q8CCJ3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ufl1Q8CCJ3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ufl1Q8CCJ3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ufl1Q8CCJ3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ufl1Q8CCJ3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ufl1Q8CCJ3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ufl1Q8CCJ3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ufl1Q8CCJ3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ufl1Q8CCJ3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ufl1Q8CCJ3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ufl1Q8CCJ3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ufl1Q8CCJ3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ufl1Q8CCJ3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ufl1Q8CCJ3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ufl1Q8CCJ3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ufl1Q8CCJ3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ufl1Q8CCJ3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ufl1Q8CCJ3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ufl1Q8CCJ3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ufl1Q8CCJ3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ufl1Q8CCJ3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ufl1Q8CCJ3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ufl1Q8CCJ3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ufl1Q8CCJ3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ufl1Q8CCJ3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ufl1Q8CCJ3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ufl1Q8CCJ3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ufl1Q8CCJ3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ufl1Q8CCJ3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ufl1Q8CCJ3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ufl1Q8CCJ3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ufl1Q8CCJ3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ufl1Q8CCJ3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ufl1Q8CCJ3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms