Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RybpQ8CCI5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RybpQ8CCI5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RybpQ8CCI5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RybpQ8CCI5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RybpQ8CCI5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RybpQ8CCI5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RybpQ8CCI5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RybpQ8CCI5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RybpQ8CCI5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RybpQ8CCI5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RybpQ8CCI5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RybpQ8CCI5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RybpQ8CCI5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RybpQ8CCI5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RybpQ8CCI5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RybpQ8CCI5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RybpQ8CCI5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RybpQ8CCI5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RybpQ8CCI5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RybpQ8CCI5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RybpQ8CCI5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RybpQ8CCI5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RybpQ8CCI5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RybpQ8CCI5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RybpQ8CCI5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms