Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0S4

Ttc21a, Tetratricopeptide repeat protein 21A, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21aQ8C0S4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ttc21aQ8C0S4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ttc21aQ8C0S4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ttc21aQ8C0S4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ttc21aQ8C0S4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ttc21aQ8C0S4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ttc21aQ8C0S4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ttc21aQ8C0S4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ttc21aQ8C0S4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttc21aQ8C0S4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttc21aQ8C0S4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttc21aQ8C0S4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttc21aQ8C0S4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttc21aQ8C0S4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttc21aQ8C0S4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttc21aQ8C0S4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttc21aQ8C0S4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttc21aQ8C0S4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttc21aQ8C0S4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttc21aQ8C0S4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttc21aQ8C0S4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttc21aQ8C0S4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ttc21aQ8C0S4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ttc21aQ8C0S4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ttc21aQ8C0S4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ttc21aQ8C0S4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ttc21aQ8C0S4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ttc21aQ8C0S4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ttc21aQ8C0S4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ttc21aQ8C0S4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ttc21aQ8C0S4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttc21aQ8C0S4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttc21aQ8C0S4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttc21aQ8C0S4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttc21aQ8C0S4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttc21aQ8C0S4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttc21aQ8C0S4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttc21aQ8C0S4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttc21aQ8C0S4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttc21aQ8C0S4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttc21aQ8C0S4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttc21aQ8C0S4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttc21aQ8C0S4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttc21aQ8C0S4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttc21aQ8C0S4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttc21aQ8C0S4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttc21aQ8C0S4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttc21aQ8C0S4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttc21aQ8C0S4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttc21aQ8C0S4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttc21aQ8C0S4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttc21aQ8C0S4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttc21aQ8C0S4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttc21aQ8C0S4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttc21aQ8C0S4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttc21aQ8C0S4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttc21aQ8C0S4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttc21aQ8C0S4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttc21aQ8C0S4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttc21aQ8C0S4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttc21aQ8C0S4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttc21aQ8C0S4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ttc21aQ8C0S4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ttc21aQ8C0S4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ttc21aQ8C0S4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ttc21aQ8C0S4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ttc21aQ8C0S4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ttc21aQ8C0S4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ttc21aQ8C0S4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ttc21aQ8C0S4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ttc21aQ8C0S4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ttc21aQ8C0S4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ttc21aQ8C0S4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ttc21aQ8C0S4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ttc21aQ8C0S4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ttc21aQ8C0S4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ttc21aQ8C0S4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ttc21aQ8C0S4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Ttc21aQ8C0S4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ttc21aQ8C0S4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttc21aQ8C0S4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttc21aQ8C0S4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttc21aQ8C0S4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttc21aQ8C0S4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttc21aQ8C0S4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttc21aQ8C0S4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttc21aQ8C0S4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ttc21aQ8C0S4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ttc21aQ8C0S4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ttc21aQ8C0S4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ttc21aQ8C0S4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ttc21aQ8C0S4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc21aQ8C0S4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc21aQ8C0S4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc21aQ8C0S4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc21aQ8C0S4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc21aQ8C0S4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttc21aQ8C0S4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttc21aQ8C0S4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttc21aQ8C0S4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms