Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdca8Q8BHX3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdca8Q8BHX3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdca8Q8BHX3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdca8Q8BHX3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdca8Q8BHX3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdca8Q8BHX3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdca8Q8BHX3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdca8Q8BHX3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdca8Q8BHX3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdca8Q8BHX3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdca8Q8BHX3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdca8Q8BHX3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdca8Q8BHX3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdca8Q8BHX3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdca8Q8BHX3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdca8Q8BHX3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdca8Q8BHX3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdca8Q8BHX3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdca8Q8BHX3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdca8Q8BHX3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdca8Q8BHX3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdca8Q8BHX3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdca8Q8BHX3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdca8Q8BHX3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdca8Q8BHX3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdca8Q8BHX3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdca8Q8BHX3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdca8Q8BHX3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdca8Q8BHX3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdca8Q8BHX3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdca8Q8BHX3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdca8Q8BHX3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdca8Q8BHX3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdca8Q8BHX3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdca8Q8BHX3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdca8Q8BHX3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdca8Q8BHX3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdca8Q8BHX3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdca8Q8BHX3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdca8Q8BHX3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdca8Q8BHX3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdca8Q8BHX3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdca8Q8BHX3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdca8Q8BHX3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdca8Q8BHX3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdca8Q8BHX3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdca8Q8BHX3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdca8Q8BHX3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdca8Q8BHX3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdca8Q8BHX3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdca8Q8BHX3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdca8Q8BHX3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdca8Q8BHX3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdca8Q8BHX3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdca8Q8BHX3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdca8Q8BHX3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdca8Q8BHX3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdca8Q8BHX3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdca8Q8BHX3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdca8Q8BHX3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdca8Q8BHX3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdca8Q8BHX3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdca8Q8BHX3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdca8Q8BHX3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdca8Q8BHX3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdca8Q8BHX3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdca8Q8BHX3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdca8Q8BHX3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdca8Q8BHX3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdca8Q8BHX3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdca8Q8BHX3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdca8Q8BHX3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdca8Q8BHX3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdca8Q8BHX3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdca8Q8BHX3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdca8Q8BHX3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdca8Q8BHX3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdca8Q8BHX3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdca8Q8BHX3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdca8Q8BHX3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdca8Q8BHX3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdca8Q8BHX3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdca8Q8BHX3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdca8Q8BHX3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdca8Q8BHX3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdca8Q8BHX3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdca8Q8BHX3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdca8Q8BHX3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdca8Q8BHX3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdca8Q8BHX3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdca8Q8BHX3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdca8Q8BHX3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdca8Q8BHX3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdca8Q8BHX3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdca8Q8BHX3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdca8Q8BHX3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdca8Q8BHX3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdca8Q8BHX3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdca8Q8BHX3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms