Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX0

4933402J07Rik, RIKEN cDNA 4933402J07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402J07RikQ8BHX0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4933402J07RikQ8BHX0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
4933402J07RikQ8BHX0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4933402J07RikQ8BHX0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4933402J07RikQ8BHX0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
4933402J07RikQ8BHX0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
4933402J07RikQ8BHX0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4933402J07RikQ8BHX0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
4933402J07RikQ8BHX0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4933402J07RikQ8BHX0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4933402J07RikQ8BHX0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4933402J07RikQ8BHX0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4933402J07RikQ8BHX0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4933402J07RikQ8BHX0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4933402J07RikQ8BHX0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4933402J07RikQ8BHX0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4933402J07RikQ8BHX0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4933402J07RikQ8BHX0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4933402J07RikQ8BHX0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4933402J07RikQ8BHX0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
4933402J07RikQ8BHX0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4933402J07RikQ8BHX0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4933402J07RikQ8BHX0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
4933402J07RikQ8BHX0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
4933402J07RikQ8BHX0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4933402J07RikQ8BHX0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
4933402J07RikQ8BHX0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
4933402J07RikQ8BHX0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
4933402J07RikQ8BHX0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
4933402J07RikQ8BHX0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
4933402J07RikQ8BHX0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4933402J07RikQ8BHX0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4933402J07RikQ8BHX0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms