Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
U2af1l4Q8BGJ9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms