Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFU8

Slc17a8, Vesicular glutamate transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc17a8Q8BFU8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc17a8Q8BFU8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc17a8Q8BFU8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc17a8Q8BFU8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc17a8Q8BFU8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc17a8Q8BFU8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc17a8Q8BFU8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc17a8Q8BFU8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc17a8Q8BFU8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc17a8Q8BFU8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc17a8Q8BFU8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc17a8Q8BFU8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Slc17a8Q8BFU8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc17a8Q8BFU8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc17a8Q8BFU8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc17a8Q8BFU8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc17a8Q8BFU8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc17a8Q8BFU8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc17a8Q8BFU8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc17a8Q8BFU8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc17a8Q8BFU8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc17a8Q8BFU8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc17a8Q8BFU8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc17a8Q8BFU8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc17a8Q8BFU8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc17a8Q8BFU8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc17a8Q8BFU8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc17a8Q8BFU8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc17a8Q8BFU8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc17a8Q8BFU8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc17a8Q8BFU8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc17a8Q8BFU8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc17a8Q8BFU8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms