Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmem39bQ810L4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmem39bQ810L4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmem39bQ810L4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmem39bQ810L4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmem39bQ810L4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmem39bQ810L4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmem39bQ810L4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem39bQ810L4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem39bQ810L4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem39bQ810L4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem39bQ810L4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem39bQ810L4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem39bQ810L4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem39bQ810L4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem39bQ810L4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tmem39bQ810L4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tmem39bQ810L4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmem39bQ810L4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmem39bQ810L4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmem39bQ810L4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmem39bQ810L4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem39bQ810L4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem39bQ810L4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem39bQ810L4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem39bQ810L4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem39bQ810L4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem39bQ810L4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem39bQ810L4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem39bQ810L4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem39bQ810L4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem39bQ810L4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem39bQ810L4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmem39bQ810L4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmem39bQ810L4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmem39bQ810L4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmem39bQ810L4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmem39bQ810L4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmem39bQ810L4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmem39bQ810L4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmem39bQ810L4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmem39bQ810L4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmem39bQ810L4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmem39bQ810L4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmem39bQ810L4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmem39bQ810L4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmem39bQ810L4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmem39bQ810L4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmem39bQ810L4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmem39bQ810L4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmem39bQ810L4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmem39bQ810L4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem39bQ810L4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem39bQ810L4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem39bQ810L4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem39bQ810L4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem39bQ810L4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem39bQ810L4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem39bQ810L4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem39bQ810L4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem39bQ810L4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem39bQ810L4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem39bQ810L4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem39bQ810L4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem39bQ810L4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem39bQ810L4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms