Protein–RNA interactions for Protein: Q80ST9

Lca5, Lebercilin, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lca5Q80ST9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lca5Q80ST9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lca5Q80ST9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lca5Q80ST9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lca5Q80ST9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lca5Q80ST9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lca5Q80ST9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lca5Q80ST9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lca5Q80ST9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lca5Q80ST9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lca5Q80ST9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lca5Q80ST9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lca5Q80ST9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lca5Q80ST9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lca5Q80ST9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lca5Q80ST9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Lca5Q80ST9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lca5Q80ST9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lca5Q80ST9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lca5Q80ST9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lca5Q80ST9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lca5Q80ST9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lca5Q80ST9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lca5Q80ST9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lca5Q80ST9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lca5Q80ST9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Lca5Q80ST9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lca5Q80ST9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lca5Q80ST9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lca5Q80ST9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lca5Q80ST9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lca5Q80ST9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lca5Q80ST9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lca5Q80ST9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lca5Q80ST9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lca5Q80ST9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lca5Q80ST9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lca5Q80ST9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Lca5Q80ST9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lca5Q80ST9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lca5Q80ST9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lca5Q80ST9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lca5Q80ST9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lca5Q80ST9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lca5Q80ST9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lca5Q80ST9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lca5Q80ST9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lca5Q80ST9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lca5Q80ST9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lca5Q80ST9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lca5Q80ST9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lca5Q80ST9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lca5Q80ST9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lca5Q80ST9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lca5Q80ST9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lca5Q80ST9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lca5Q80ST9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lca5Q80ST9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lca5Q80ST9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lca5Q80ST9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lca5Q80ST9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lca5Q80ST9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lca5Q80ST9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lca5Q80ST9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lca5Q80ST9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lca5Q80ST9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lca5Q80ST9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lca5Q80ST9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lca5Q80ST9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lca5Q80ST9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lca5Q80ST9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lca5Q80ST9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lca5Q80ST9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lca5Q80ST9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lca5Q80ST9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lca5Q80ST9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lca5Q80ST9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lca5Q80ST9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lca5Q80ST9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lca5Q80ST9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 706.2 ms