Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctdp1Q7TSG2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctdp1Q7TSG2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctdp1Q7TSG2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctdp1Q7TSG2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctdp1Q7TSG2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctdp1Q7TSG2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ctdp1Q7TSG2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ctdp1Q7TSG2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ctdp1Q7TSG2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctdp1Q7TSG2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctdp1Q7TSG2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctdp1Q7TSG2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctdp1Q7TSG2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctdp1Q7TSG2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctdp1Q7TSG2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctdp1Q7TSG2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctdp1Q7TSG2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctdp1Q7TSG2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctdp1Q7TSG2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctdp1Q7TSG2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctdp1Q7TSG2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctdp1Q7TSG2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctdp1Q7TSG2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctdp1Q7TSG2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctdp1Q7TSG2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctdp1Q7TSG2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctdp1Q7TSG2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctdp1Q7TSG2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctdp1Q7TSG2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctdp1Q7TSG2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctdp1Q7TSG2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctdp1Q7TSG2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctdp1Q7TSG2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctdp1Q7TSG2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctdp1Q7TSG2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctdp1Q7TSG2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctdp1Q7TSG2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctdp1Q7TSG2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctdp1Q7TSG2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctdp1Q7TSG2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctdp1Q7TSG2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctdp1Q7TSG2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctdp1Q7TSG2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctdp1Q7TSG2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctdp1Q7TSG2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctdp1Q7TSG2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctdp1Q7TSG2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctdp1Q7TSG2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctdp1Q7TSG2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctdp1Q7TSG2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctdp1Q7TSG2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctdp1Q7TSG2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctdp1Q7TSG2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctdp1Q7TSG2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctdp1Q7TSG2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctdp1Q7TSG2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctdp1Q7TSG2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctdp1Q7TSG2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctdp1Q7TSG2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctdp1Q7TSG2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctdp1Q7TSG2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctdp1Q7TSG2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctdp1Q7TSG2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctdp1Q7TSG2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms