Protein–RNA interactions for Protein: Q7TND5

Rpf1, Ribosome production factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf1Q7TND5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rpf1Q7TND5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rpf1Q7TND5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpf1Q7TND5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpf1Q7TND5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpf1Q7TND5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Rpf1Q7TND5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Rpf1Q7TND5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpf1Q7TND5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpf1Q7TND5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpf1Q7TND5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rpf1Q7TND5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpf1Q7TND5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpf1Q7TND5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rpf1Q7TND5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpf1Q7TND5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rpf1Q7TND5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpf1Q7TND5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpf1Q7TND5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpf1Q7TND5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpf1Q7TND5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rpf1Q7TND5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rpf1Q7TND5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpf1Q7TND5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rpf1Q7TND5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpf1Q7TND5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rpf1Q7TND5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpf1Q7TND5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpf1Q7TND5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Rpf1Q7TND5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rpf1Q7TND5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rpf1Q7TND5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rpf1Q7TND5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rpf1Q7TND5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpf1Q7TND5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpf1Q7TND5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rpf1Q7TND5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpf1Q7TND5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpf1Q7TND5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpf1Q7TND5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpf1Q7TND5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpf1Q7TND5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpf1Q7TND5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpf1Q7TND5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rpf1Q7TND5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpf1Q7TND5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rpf1Q7TND5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpf1Q7TND5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpf1Q7TND5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpf1Q7TND5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpf1Q7TND5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rpf1Q7TND5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpf1Q7TND5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Rpf1Q7TND5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpf1Q7TND5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rpf1Q7TND5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpf1Q7TND5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpf1Q7TND5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms