Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pdcl2Q78Y63 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdcl2Q78Y63 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdcl2Q78Y63 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdcl2Q78Y63 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdcl2Q78Y63 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdcl2Q78Y63 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdcl2Q78Y63 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdcl2Q78Y63 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdcl2Q78Y63 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdcl2Q78Y63 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdcl2Q78Y63 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdcl2Q78Y63 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdcl2Q78Y63 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdcl2Q78Y63 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdcl2Q78Y63 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdcl2Q78Y63 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdcl2Q78Y63 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdcl2Q78Y63 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdcl2Q78Y63 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdcl2Q78Y63 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdcl2Q78Y63 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdcl2Q78Y63 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdcl2Q78Y63 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdcl2Q78Y63 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdcl2Q78Y63 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdcl2Q78Y63 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdcl2Q78Y63 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdcl2Q78Y63 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdcl2Q78Y63 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdcl2Q78Y63 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdcl2Q78Y63 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdcl2Q78Y63 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdcl2Q78Y63 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdcl2Q78Y63 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdcl2Q78Y63 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdcl2Q78Y63 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdcl2Q78Y63 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdcl2Q78Y63 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdcl2Q78Y63 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdcl2Q78Y63 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdcl2Q78Y63 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdcl2Q78Y63 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdcl2Q78Y63 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdcl2Q78Y63 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdcl2Q78Y63 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdcl2Q78Y63 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdcl2Q78Y63 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdcl2Q78Y63 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdcl2Q78Y63 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdcl2Q78Y63 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdcl2Q78Y63 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms