Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd3eapQ76KJ5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd3eapQ76KJ5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd3eapQ76KJ5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd3eapQ76KJ5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd3eapQ76KJ5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd3eapQ76KJ5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd3eapQ76KJ5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd3eapQ76KJ5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd3eapQ76KJ5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cd3eapQ76KJ5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd3eapQ76KJ5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd3eapQ76KJ5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd3eapQ76KJ5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd3eapQ76KJ5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd3eapQ76KJ5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd3eapQ76KJ5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd3eapQ76KJ5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd3eapQ76KJ5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd3eapQ76KJ5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd3eapQ76KJ5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd3eapQ76KJ5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd3eapQ76KJ5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd3eapQ76KJ5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd3eapQ76KJ5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd3eapQ76KJ5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd3eapQ76KJ5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd3eapQ76KJ5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd3eapQ76KJ5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd3eapQ76KJ5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd3eapQ76KJ5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd3eapQ76KJ5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd3eapQ76KJ5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms