Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp34Q6ZQ93 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp34Q6ZQ93 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp34Q6ZQ93 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp34Q6ZQ93 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp34Q6ZQ93 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp34Q6ZQ93 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp34Q6ZQ93 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp34Q6ZQ93 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp34Q6ZQ93 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp34Q6ZQ93 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp34Q6ZQ93 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp34Q6ZQ93 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp34Q6ZQ93 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp34Q6ZQ93 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp34Q6ZQ93 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp34Q6ZQ93 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp34Q6ZQ93 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp34Q6ZQ93 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Usp34Q6ZQ93 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp34Q6ZQ93 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp34Q6ZQ93 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp34Q6ZQ93 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp34Q6ZQ93 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp34Q6ZQ93 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp34Q6ZQ93 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp34Q6ZQ93 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp34Q6ZQ93 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp34Q6ZQ93 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp34Q6ZQ93 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp34Q6ZQ93 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp34Q6ZQ93 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp34Q6ZQ93 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp34Q6ZQ93 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp34Q6ZQ93 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp34Q6ZQ93 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp34Q6ZQ93 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp34Q6ZQ93 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp34Q6ZQ93 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp34Q6ZQ93 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp34Q6ZQ93 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp34Q6ZQ93 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp34Q6ZQ93 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp34Q6ZQ93 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp34Q6ZQ93 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp34Q6ZQ93 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp34Q6ZQ93 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp34Q6ZQ93 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp34Q6ZQ93 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp34Q6ZQ93 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp34Q6ZQ93 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp34Q6ZQ93 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp34Q6ZQ93 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp34Q6ZQ93 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp34Q6ZQ93 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp34Q6ZQ93 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp34Q6ZQ93 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp34Q6ZQ93 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp34Q6ZQ93 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp34Q6ZQ93 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp34Q6ZQ93 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp34Q6ZQ93 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp34Q6ZQ93 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp34Q6ZQ93 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp34Q6ZQ93 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp34Q6ZQ93 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp34Q6ZQ93 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp34Q6ZQ93 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp34Q6ZQ93 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp34Q6ZQ93 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp34Q6ZQ93 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp34Q6ZQ93 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp34Q6ZQ93 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp34Q6ZQ93 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp34Q6ZQ93 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp34Q6ZQ93 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp34Q6ZQ93 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp34Q6ZQ93 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp34Q6ZQ93 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp34Q6ZQ93 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp34Q6ZQ93 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp34Q6ZQ93 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp34Q6ZQ93 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp34Q6ZQ93 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp34Q6ZQ93 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp34Q6ZQ93 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp34Q6ZQ93 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp34Q6ZQ93 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp34Q6ZQ93 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp34Q6ZQ93 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp34Q6ZQ93 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp34Q6ZQ93 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp34Q6ZQ93 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp34Q6ZQ93 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp34Q6ZQ93 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp34Q6ZQ93 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp34Q6ZQ93 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp34Q6ZQ93 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp34Q6ZQ93 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp34Q6ZQ93 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms