Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPZ3

Zc3h4, Zinc finger CCCH domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zc3h4Q6ZPZ3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zc3h4Q6ZPZ3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zc3h4Q6ZPZ3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zc3h4Q6ZPZ3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zc3h4Q6ZPZ3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zc3h4Q6ZPZ3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zc3h4Q6ZPZ3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Zc3h4Q6ZPZ3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zc3h4Q6ZPZ3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zc3h4Q6ZPZ3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zc3h4Q6ZPZ3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zc3h4Q6ZPZ3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zc3h4Q6ZPZ3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zc3h4Q6ZPZ3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zc3h4Q6ZPZ3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zc3h4Q6ZPZ3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Zc3h4Q6ZPZ3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Zc3h4Q6ZPZ3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Zc3h4Q6ZPZ3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Zc3h4Q6ZPZ3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zc3h4Q6ZPZ3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zc3h4Q6ZPZ3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Zc3h4Q6ZPZ3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Zc3h4Q6ZPZ3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zc3h4Q6ZPZ3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zc3h4Q6ZPZ3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zc3h4Q6ZPZ3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zc3h4Q6ZPZ3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zc3h4Q6ZPZ3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zc3h4Q6ZPZ3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zc3h4Q6ZPZ3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Zc3h4Q6ZPZ3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zc3h4Q6ZPZ3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zc3h4Q6ZPZ3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zc3h4Q6ZPZ3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zc3h4Q6ZPZ3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zc3h4Q6ZPZ3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zc3h4Q6ZPZ3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Zc3h4Q6ZPZ3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zc3h4Q6ZPZ3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zc3h4Q6ZPZ3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zc3h4Q6ZPZ3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zc3h4Q6ZPZ3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zc3h4Q6ZPZ3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Zc3h4Q6ZPZ3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zc3h4Q6ZPZ3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms