Protein–RNA interactions for Protein: Q6W9L1

H2-M2, Histocompatibility 2, M region locus 2, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M2Q6W9L1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2-M2Q6W9L1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-M2Q6W9L1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms