Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY53

AY358078, HN1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AY358078Q6UY53 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AY358078Q6UY53 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AY358078Q6UY53 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
AY358078Q6UY53 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AY358078Q6UY53 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
AY358078Q6UY53 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
AY358078Q6UY53 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
AY358078Q6UY53 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
AY358078Q6UY53 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AY358078Q6UY53 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
AY358078Q6UY53 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AY358078Q6UY53 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AY358078Q6UY53 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AY358078Q6UY53 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AY358078Q6UY53 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AY358078Q6UY53 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AY358078Q6UY53 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AY358078Q6UY53 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
AY358078Q6UY53 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
AY358078Q6UY53 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
AY358078Q6UY53 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AY358078Q6UY53 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AY358078Q6UY53 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AY358078Q6UY53 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AY358078Q6UY53 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AY358078Q6UY53 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AY358078Q6UY53 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AY358078Q6UY53 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AY358078Q6UY53 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AY358078Q6UY53 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AY358078Q6UY53 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AY358078Q6UY53 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AY358078Q6UY53 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AY358078Q6UY53 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
AY358078Q6UY53 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AY358078Q6UY53 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AY358078Q6UY53 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AY358078Q6UY53 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AY358078Q6UY53 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AY358078Q6UY53 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AY358078Q6UY53 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms