Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9N8

Trak2, Trafficking protein, kinesin-binding 2, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak2Q6P9N8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trak2Q6P9N8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trak2Q6P9N8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trak2Q6P9N8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Trak2Q6P9N8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trak2Q6P9N8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trak2Q6P9N8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trak2Q6P9N8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trak2Q6P9N8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trak2Q6P9N8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trak2Q6P9N8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trak2Q6P9N8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trak2Q6P9N8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trak2Q6P9N8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trak2Q6P9N8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trak2Q6P9N8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trak2Q6P9N8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trak2Q6P9N8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trak2Q6P9N8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trak2Q6P9N8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trak2Q6P9N8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trak2Q6P9N8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trak2Q6P9N8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trak2Q6P9N8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trak2Q6P9N8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trak2Q6P9N8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trak2Q6P9N8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trak2Q6P9N8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trak2Q6P9N8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trak2Q6P9N8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trak2Q6P9N8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trak2Q6P9N8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trak2Q6P9N8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trak2Q6P9N8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trak2Q6P9N8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trak2Q6P9N8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trak2Q6P9N8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trak2Q6P9N8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trak2Q6P9N8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trak2Q6P9N8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trak2Q6P9N8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trak2Q6P9N8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trak2Q6P9N8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trak2Q6P9N8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trak2Q6P9N8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trak2Q6P9N8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trak2Q6P9N8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trak2Q6P9N8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trak2Q6P9N8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trak2Q6P9N8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trak2Q6P9N8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trak2Q6P9N8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trak2Q6P9N8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trak2Q6P9N8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trak2Q6P9N8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trak2Q6P9N8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trak2Q6P9N8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trak2Q6P9N8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trak2Q6P9N8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trak2Q6P9N8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trak2Q6P9N8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Trak2Q6P9N8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trak2Q6P9N8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trak2Q6P9N8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trak2Q6P9N8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trak2Q6P9N8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trak2Q6P9N8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trak2Q6P9N8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trak2Q6P9N8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trak2Q6P9N8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trak2Q6P9N8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trak2Q6P9N8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trak2Q6P9N8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trak2Q6P9N8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trak2Q6P9N8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trak2Q6P9N8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trak2Q6P9N8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trak2Q6P9N8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Trak2Q6P9N8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trak2Q6P9N8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trak2Q6P9N8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trak2Q6P9N8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trak2Q6P9N8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trak2Q6P9N8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trak2Q6P9N8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trak2Q6P9N8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trak2Q6P9N8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trak2Q6P9N8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trak2Q6P9N8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trak2Q6P9N8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trak2Q6P9N8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trak2Q6P9N8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trak2Q6P9N8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trak2Q6P9N8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trak2Q6P9N8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trak2Q6P9N8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trak2Q6P9N8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trak2Q6P9N8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trak2Q6P9N8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trak2Q6P9N8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms