Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2K6

Ppp4r3a, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 3A, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3aQ6P2K6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppp4r3aQ6P2K6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppp4r3aQ6P2K6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppp4r3aQ6P2K6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp4r3aQ6P2K6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp4r3aQ6P2K6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp4r3aQ6P2K6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp4r3aQ6P2K6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp4r3aQ6P2K6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp4r3aQ6P2K6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp4r3aQ6P2K6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp4r3aQ6P2K6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp4r3aQ6P2K6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp4r3aQ6P2K6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp4r3aQ6P2K6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp4r3aQ6P2K6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp4r3aQ6P2K6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp4r3aQ6P2K6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp4r3aQ6P2K6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp4r3aQ6P2K6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp4r3aQ6P2K6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp4r3aQ6P2K6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp4r3aQ6P2K6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp4r3aQ6P2K6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp4r3aQ6P2K6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp4r3aQ6P2K6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp4r3aQ6P2K6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp4r3aQ6P2K6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp4r3aQ6P2K6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppp4r3aQ6P2K6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppp4r3aQ6P2K6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppp4r3aQ6P2K6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppp4r3aQ6P2K6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppp4r3aQ6P2K6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
Ppp4r3aQ6P2K6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms