Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rprd2Q6NXI6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rprd2Q6NXI6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rprd2Q6NXI6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rprd2Q6NXI6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rprd2Q6NXI6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rprd2Q6NXI6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rprd2Q6NXI6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rprd2Q6NXI6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rprd2Q6NXI6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rprd2Q6NXI6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rprd2Q6NXI6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rprd2Q6NXI6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Rprd2Q6NXI6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rprd2Q6NXI6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rprd2Q6NXI6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rprd2Q6NXI6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rprd2Q6NXI6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rprd2Q6NXI6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rprd2Q6NXI6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rprd2Q6NXI6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rprd2Q6NXI6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rprd2Q6NXI6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rprd2Q6NXI6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rprd2Q6NXI6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rprd2Q6NXI6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rprd2Q6NXI6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rprd2Q6NXI6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rprd2Q6NXI6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rprd2Q6NXI6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rprd2Q6NXI6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rprd2Q6NXI6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rprd2Q6NXI6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rprd2Q6NXI6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rprd2Q6NXI6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rprd2Q6NXI6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rprd2Q6NXI6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rprd2Q6NXI6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rprd2Q6NXI6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rprd2Q6NXI6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rprd2Q6NXI6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rprd2Q6NXI6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rprd2Q6NXI6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rprd2Q6NXI6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rprd2Q6NXI6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rprd2Q6NXI6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Rprd2Q6NXI6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rprd2Q6NXI6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rprd2Q6NXI6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rprd2Q6NXI6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rprd2Q6NXI6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Rprd2Q6NXI6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rprd2Q6NXI6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rprd2Q6NXI6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rprd2Q6NXI6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rprd2Q6NXI6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rprd2Q6NXI6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rprd2Q6NXI6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rprd2Q6NXI6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rprd2Q6NXI6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rprd2Q6NXI6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rprd2Q6NXI6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rprd2Q6NXI6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rprd2Q6NXI6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rprd2Q6NXI6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Rprd2Q6NXI6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rprd2Q6NXI6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rprd2Q6NXI6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rprd2Q6NXI6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rprd2Q6NXI6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rprd2Q6NXI6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rprd2Q6NXI6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rprd2Q6NXI6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rprd2Q6NXI6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rprd2Q6NXI6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rprd2Q6NXI6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rprd2Q6NXI6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rprd2Q6NXI6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rprd2Q6NXI6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rprd2Q6NXI6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rprd2Q6NXI6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rprd2Q6NXI6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rprd2Q6NXI6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rprd2Q6NXI6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Rprd2Q6NXI6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Rprd2Q6NXI6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Rprd2Q6NXI6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rprd2Q6NXI6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rprd2Q6NXI6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rprd2Q6NXI6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rprd2Q6NXI6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rprd2Q6NXI6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Rprd2Q6NXI6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rprd2Q6NXI6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rprd2Q6NXI6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rprd2Q6NXI6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rprd2Q6NXI6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rprd2Q6NXI6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rprd2Q6NXI6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rprd2Q6NXI6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms