Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gpbp1Q6NXH3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gpbp1Q6NXH3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gpbp1Q6NXH3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gpbp1Q6NXH3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gpbp1Q6NXH3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gpbp1Q6NXH3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gpbp1Q6NXH3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gpbp1Q6NXH3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpbp1Q6NXH3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpbp1Q6NXH3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpbp1Q6NXH3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gpbp1Q6NXH3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gpbp1Q6NXH3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gpbp1Q6NXH3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gpbp1Q6NXH3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gpbp1Q6NXH3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gpbp1Q6NXH3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gpbp1Q6NXH3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gpbp1Q6NXH3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gpbp1Q6NXH3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gpbp1Q6NXH3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gpbp1Q6NXH3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gpbp1Q6NXH3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gpbp1Q6NXH3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gpbp1Q6NXH3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpbp1Q6NXH3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpbp1Q6NXH3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpbp1Q6NXH3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpbp1Q6NXH3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpbp1Q6NXH3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpbp1Q6NXH3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpbp1Q6NXH3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpbp1Q6NXH3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpbp1Q6NXH3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpbp1Q6NXH3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gpbp1Q6NXH3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gpbp1Q6NXH3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gpbp1Q6NXH3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gpbp1Q6NXH3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gpbp1Q6NXH3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gpbp1Q6NXH3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gpbp1Q6NXH3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gpbp1Q6NXH3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gpbp1Q6NXH3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gpbp1Q6NXH3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gpbp1Q6NXH3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gpbp1Q6NXH3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gpbp1Q6NXH3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gpbp1Q6NXH3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gpbp1Q6NXH3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gpbp1Q6NXH3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gpbp1Q6NXH3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gpbp1Q6NXH3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gpbp1Q6NXH3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gpbp1Q6NXH3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gpbp1Q6NXH3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gpbp1Q6NXH3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gpbp1Q6NXH3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gpbp1Q6NXH3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gpbp1Q6NXH3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gpbp1Q6NXH3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gpbp1Q6NXH3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gpbp1Q6NXH3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gpbp1Q6NXH3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gpbp1Q6NXH3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gpbp1Q6NXH3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gpbp1Q6NXH3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gpbp1Q6NXH3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gpbp1Q6NXH3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gpbp1Q6NXH3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gpbp1Q6NXH3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gpbp1Q6NXH3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gpbp1Q6NXH3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gpbp1Q6NXH3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gpbp1Q6NXH3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gpbp1Q6NXH3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gpbp1Q6NXH3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gpbp1Q6NXH3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gpbp1Q6NXH3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gpbp1Q6NXH3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gpbp1Q6NXH3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gpbp1Q6NXH3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gpbp1Q6NXH3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gpbp1Q6NXH3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gpbp1Q6NXH3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gpbp1Q6NXH3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpbp1Q6NXH3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpbp1Q6NXH3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpbp1Q6NXH3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpbp1Q6NXH3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpbp1Q6NXH3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpbp1Q6NXH3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpbp1Q6NXH3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gpbp1Q6NXH3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gpbp1Q6NXH3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gpbp1Q6NXH3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gpbp1Q6NXH3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gpbp1Q6NXH3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gpbp1Q6NXH3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms