Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Hecw2Q6I6G8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Hecw2Q6I6G8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Hecw2Q6I6G8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Hecw2Q6I6G8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Hecw2Q6I6G8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Hecw2Q6I6G8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Hecw2Q6I6G8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Hecw2Q6I6G8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Hecw2Q6I6G8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Hecw2Q6I6G8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Hecw2Q6I6G8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Hecw2Q6I6G8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Hecw2Q6I6G8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Hecw2Q6I6G8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Hecw2Q6I6G8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Hecw2Q6I6G8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Hecw2Q6I6G8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Hecw2Q6I6G8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Hecw2Q6I6G8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Hecw2Q6I6G8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Hecw2Q6I6G8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Hecw2Q6I6G8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Hecw2Q6I6G8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Hecw2Q6I6G8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Hecw2Q6I6G8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Hecw2Q6I6G8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Hecw2Q6I6G8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Hecw2Q6I6G8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Hecw2Q6I6G8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Hecw2Q6I6G8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Hecw2Q6I6G8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Hecw2Q6I6G8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Hecw2Q6I6G8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Hecw2Q6I6G8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Hecw2Q6I6G8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Hecw2Q6I6G8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Hecw2Q6I6G8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Hecw2Q6I6G8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Hecw2Q6I6G8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Hecw2Q6I6G8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Hecw2Q6I6G8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Hecw2Q6I6G8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Hecw2Q6I6G8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Hecw2Q6I6G8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Hecw2Q6I6G8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Hecw2Q6I6G8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Hecw2Q6I6G8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Hecw2Q6I6G8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Hecw2Q6I6G8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Hecw2Q6I6G8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Hecw2Q6I6G8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Hecw2Q6I6G8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Hecw2Q6I6G8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Hecw2Q6I6G8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Hecw2Q6I6G8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Hecw2Q6I6G8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Hecw2Q6I6G8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Hecw2Q6I6G8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Hecw2Q6I6G8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Hecw2Q6I6G8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Hecw2Q6I6G8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Hecw2Q6I6G8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Hecw2Q6I6G8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Hecw2Q6I6G8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Hecw2Q6I6G8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Hecw2Q6I6G8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Hecw2Q6I6G8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Hecw2Q6I6G8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Hecw2Q6I6G8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Hecw2Q6I6G8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Hecw2Q6I6G8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Hecw2Q6I6G8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Hecw2Q6I6G8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Hecw2Q6I6G8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Hecw2Q6I6G8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Hecw2Q6I6G8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Hecw2Q6I6G8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Hecw2Q6I6G8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Hecw2Q6I6G8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Hecw2Q6I6G8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Hecw2Q6I6G8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Hecw2Q6I6G8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Hecw2Q6I6G8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Hecw2Q6I6G8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Hecw2Q6I6G8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Hecw2Q6I6G8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Hecw2Q6I6G8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Hecw2Q6I6G8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Hecw2Q6I6G8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Hecw2Q6I6G8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
Hecw2Q6I6G8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Hecw2Q6I6G8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
Hecw2Q6I6G8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Hecw2Q6I6G8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Hecw2Q6I6G8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Hecw2Q6I6G8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Hecw2Q6I6G8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Hecw2Q6I6G8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Hecw2Q6I6G8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.5 ms