Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp4Q68FH0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp4Q68FH0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkp4Q68FH0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkp4Q68FH0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkp4Q68FH0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp4Q68FH0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp4Q68FH0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp4Q68FH0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp4Q68FH0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp4Q68FH0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp4Q68FH0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp4Q68FH0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp4Q68FH0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp4Q68FH0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp4Q68FH0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp4Q68FH0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp4Q68FH0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp4Q68FH0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp4Q68FH0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp4Q68FH0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp4Q68FH0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp4Q68FH0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp4Q68FH0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp4Q68FH0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp4Q68FH0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp4Q68FH0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp4Q68FH0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp4Q68FH0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp4Q68FH0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp4Q68FH0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp4Q68FH0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp4Q68FH0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp4Q68FH0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkp4Q68FH0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkp4Q68FH0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkp4Q68FH0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkp4Q68FH0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkp4Q68FH0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkp4Q68FH0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkp4Q68FH0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkp4Q68FH0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkp4Q68FH0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkp4Q68FH0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkp4Q68FH0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkp4Q68FH0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkp4Q68FH0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkp4Q68FH0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkp4Q68FH0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkp4Q68FH0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkp4Q68FH0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkp4Q68FH0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp4Q68FH0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp4Q68FH0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp4Q68FH0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp4Q68FH0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp4Q68FH0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp4Q68FH0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkp4Q68FH0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkp4Q68FH0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkp4Q68FH0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkp4Q68FH0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkp4Q68FH0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkp4Q68FH0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkp4Q68FH0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp4Q68FH0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp4Q68FH0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp4Q68FH0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp4Q68FH0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp4Q68FH0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp4Q68FH0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp4Q68FH0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp4Q68FH0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp4Q68FH0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp4Q68FH0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp4Q68FH0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp4Q68FH0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp4Q68FH0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp4Q68FH0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp4Q68FH0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp4Q68FH0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp4Q68FH0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp4Q68FH0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp4Q68FH0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp4Q68FH0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp4Q68FH0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp4Q68FH0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp4Q68FH0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp4Q68FH0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp4Q68FH0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp4Q68FH0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp4Q68FH0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp4Q68FH0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp4Q68FH0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp4Q68FH0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp4Q68FH0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp4Q68FH0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp4Q68FH0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp4Q68FH0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp4Q68FH0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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