Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sbno1Q689Z5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sbno1Q689Z5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sbno1Q689Z5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sbno1Q689Z5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Sbno1Q689Z5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sbno1Q689Z5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sbno1Q689Z5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sbno1Q689Z5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Sbno1Q689Z5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sbno1Q689Z5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sbno1Q689Z5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sbno1Q689Z5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sbno1Q689Z5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sbno1Q689Z5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sbno1Q689Z5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sbno1Q689Z5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sbno1Q689Z5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sbno1Q689Z5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sbno1Q689Z5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sbno1Q689Z5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Sbno1Q689Z5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sbno1Q689Z5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Sbno1Q689Z5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Sbno1Q689Z5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sbno1Q689Z5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sbno1Q689Z5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sbno1Q689Z5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sbno1Q689Z5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sbno1Q689Z5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sbno1Q689Z5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sbno1Q689Z5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sbno1Q689Z5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sbno1Q689Z5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sbno1Q689Z5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sbno1Q689Z5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sbno1Q689Z5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sbno1Q689Z5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sbno1Q689Z5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Sbno1Q689Z5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sbno1Q689Z5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sbno1Q689Z5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sbno1Q689Z5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sbno1Q689Z5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sbno1Q689Z5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sbno1Q689Z5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sbno1Q689Z5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sbno1Q689Z5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sbno1Q689Z5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Sbno1Q689Z5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sbno1Q689Z5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sbno1Q689Z5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sbno1Q689Z5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sbno1Q689Z5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sbno1Q689Z5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sbno1Q689Z5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sbno1Q689Z5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sbno1Q689Z5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sbno1Q689Z5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sbno1Q689Z5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sbno1Q689Z5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sbno1Q689Z5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sbno1Q689Z5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sbno1Q689Z5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sbno1Q689Z5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sbno1Q689Z5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sbno1Q689Z5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Sbno1Q689Z5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sbno1Q689Z5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sbno1Q689Z5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sbno1Q689Z5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sbno1Q689Z5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sbno1Q689Z5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sbno1Q689Z5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sbno1Q689Z5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sbno1Q689Z5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sbno1Q689Z5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sbno1Q689Z5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sbno1Q689Z5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sbno1Q689Z5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sbno1Q689Z5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sbno1Q689Z5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sbno1Q689Z5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sbno1Q689Z5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sbno1Q689Z5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sbno1Q689Z5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sbno1Q689Z5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sbno1Q689Z5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sbno1Q689Z5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sbno1Q689Z5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sbno1Q689Z5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sbno1Q689Z5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sbno1Q689Z5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sbno1Q689Z5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sbno1Q689Z5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sbno1Q689Z5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sbno1Q689Z5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sbno1Q689Z5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sbno1Q689Z5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sbno1Q689Z5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms