Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Lrrc8eQ66JT1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lrrc8eQ66JT1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrc8eQ66JT1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms