Protein–RNA interactions for Protein: Q64092

Tfe3, Transcription factor E3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfe3Q64092 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tfe3Q64092 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tfe3Q64092 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tfe3Q64092 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tfe3Q64092 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tfe3Q64092 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tfe3Q64092 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tfe3Q64092 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tfe3Q64092 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tfe3Q64092 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tfe3Q64092 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tfe3Q64092 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tfe3Q64092 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tfe3Q64092 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tfe3Q64092 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tfe3Q64092 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tfe3Q64092 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tfe3Q64092 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tfe3Q64092 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tfe3Q64092 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tfe3Q64092 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tfe3Q64092 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tfe3Q64092 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tfe3Q64092 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tfe3Q64092 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tfe3Q64092 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tfe3Q64092 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tfe3Q64092 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tfe3Q64092 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tfe3Q64092 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tfe3Q64092 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tfe3Q64092 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tfe3Q64092 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tfe3Q64092 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tfe3Q64092 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms