Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PatjQ63ZW7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PatjQ63ZW7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PatjQ63ZW7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PatjQ63ZW7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PatjQ63ZW7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PatjQ63ZW7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PatjQ63ZW7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PatjQ63ZW7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PatjQ63ZW7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PatjQ63ZW7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PatjQ63ZW7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PatjQ63ZW7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PatjQ63ZW7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PatjQ63ZW7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms