Protein–RNA interactions for Protein: Q62520

Zic2, Zinc finger protein ZIC 2, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic2Q62520 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zic2Q62520 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Zic2Q62520 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Zic2Q62520 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zic2Q62520 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zic2Q62520 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zic2Q62520 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zic2Q62520 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zic2Q62520 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zic2Q62520 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Zic2Q62520 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zic2Q62520 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zic2Q62520 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zic2Q62520 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zic2Q62520 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zic2Q62520 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zic2Q62520 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zic2Q62520 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zic2Q62520 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zic2Q62520 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zic2Q62520 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zic2Q62520 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zic2Q62520 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zic2Q62520 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms