Protein–RNA interactions for Protein: Q62192

Cd180, CD180 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd180Q62192 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd180Q62192 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cd180Q62192 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd180Q62192 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd180Q62192 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd180Q62192 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd180Q62192 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd180Q62192 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd180Q62192 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd180Q62192 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd180Q62192 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd180Q62192 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd180Q62192 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd180Q62192 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd180Q62192 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd180Q62192 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd180Q62192 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd180Q62192 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd180Q62192 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd180Q62192 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd180Q62192 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd180Q62192 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd180Q62192 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd180Q62192 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd180Q62192 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd180Q62192 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd180Q62192 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd180Q62192 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd180Q62192 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd180Q62192 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd180Q62192 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd180Q62192 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd180Q62192 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd180Q62192 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd180Q62192 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd180Q62192 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd180Q62192 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd180Q62192 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd180Q62192 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd180Q62192 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd180Q62192 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd180Q62192 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd180Q62192 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd180Q62192 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd180Q62192 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd180Q62192 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd180Q62192 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd180Q62192 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cd180Q62192 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms