Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DbpQ60925 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DbpQ60925 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DbpQ60925 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DbpQ60925 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DbpQ60925 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DbpQ60925 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms