Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdkn2cQ60772 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdkn2cQ60772 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdkn2cQ60772 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdkn2cQ60772 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdkn2cQ60772 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdkn2cQ60772 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdkn2cQ60772 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdkn2cQ60772 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdkn2cQ60772 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdkn2cQ60772 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdkn2cQ60772 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdkn2cQ60772 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdkn2cQ60772 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdkn2cQ60772 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdkn2cQ60772 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdkn2cQ60772 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdkn2cQ60772 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdkn2cQ60772 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdkn2cQ60772 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdkn2cQ60772 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdkn2cQ60772 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdkn2cQ60772 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdkn2cQ60772 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdkn2cQ60772 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdkn2cQ60772 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdkn2cQ60772 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdkn2cQ60772 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdkn2cQ60772 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdkn2cQ60772 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdkn2cQ60772 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdkn2cQ60772 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdkn2cQ60772 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdkn2cQ60772 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdkn2cQ60772 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdkn2cQ60772 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdkn2cQ60772 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdkn2cQ60772 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdkn2cQ60772 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdkn2cQ60772 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdkn2cQ60772 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdkn2cQ60772 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdkn2cQ60772 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdkn2cQ60772 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdkn2cQ60772 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdkn2cQ60772 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdkn2cQ60772 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdkn2cQ60772 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdkn2cQ60772 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdkn2cQ60772 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdkn2cQ60772 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cdkn2cQ60772 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cdkn2cQ60772 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdkn2cQ60772 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdkn2cQ60772 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdkn2cQ60772 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdkn2cQ60772 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdkn2cQ60772 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdkn2cQ60772 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdkn2cQ60772 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdkn2cQ60772 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdkn2cQ60772 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdkn2cQ60772 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdkn2cQ60772 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdkn2cQ60772 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdkn2cQ60772 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdkn2cQ60772 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdkn2cQ60772 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdkn2cQ60772 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdkn2cQ60772 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdkn2cQ60772 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdkn2cQ60772 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdkn2cQ60772 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdkn2cQ60772 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdkn2cQ60772 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdkn2cQ60772 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdkn2cQ60772 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdkn2cQ60772 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdkn2cQ60772 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdkn2cQ60772 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdkn2cQ60772 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdkn2cQ60772 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdkn2cQ60772 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdkn2cQ60772 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdkn2cQ60772 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdkn2cQ60772 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdkn2cQ60772 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdkn2cQ60772 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdkn2cQ60772 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdkn2cQ60772 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdkn2cQ60772 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdkn2cQ60772 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdkn2cQ60772 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdkn2cQ60772 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdkn2cQ60772 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdkn2cQ60772 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdkn2cQ60772 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdkn2cQ60772 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdkn2cQ60772 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdkn2cQ60772 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms