Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rnf123Q5XPI3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Rnf123Q5XPI3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf123Q5XPI3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf123Q5XPI3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf123Q5XPI3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf123Q5XPI3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf123Q5XPI3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rnf123Q5XPI3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rnf123Q5XPI3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rnf123Q5XPI3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rnf123Q5XPI3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rnf123Q5XPI3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rnf123Q5XPI3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rnf123Q5XPI3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rnf123Q5XPI3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rnf123Q5XPI3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rnf123Q5XPI3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rnf123Q5XPI3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rnf123Q5XPI3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rnf123Q5XPI3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rnf123Q5XPI3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rnf123Q5XPI3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rnf123Q5XPI3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rnf123Q5XPI3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rnf123Q5XPI3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rnf123Q5XPI3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rnf123Q5XPI3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rnf123Q5XPI3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rnf123Q5XPI3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rnf123Q5XPI3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rnf123Q5XPI3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rnf123Q5XPI3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rnf123Q5XPI3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rnf123Q5XPI3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rnf123Q5XPI3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf123Q5XPI3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf123Q5XPI3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf123Q5XPI3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf123Q5XPI3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf123Q5XPI3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf123Q5XPI3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf123Q5XPI3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf123Q5XPI3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf123Q5XPI3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf123Q5XPI3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf123Q5XPI3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf123Q5XPI3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf123Q5XPI3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf123Q5XPI3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf123Q5XPI3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf123Q5XPI3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf123Q5XPI3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf123Q5XPI3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf123Q5XPI3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf123Q5XPI3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf123Q5XPI3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf123Q5XPI3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf123Q5XPI3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf123Q5XPI3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rnf123Q5XPI3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rnf123Q5XPI3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf123Q5XPI3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf123Q5XPI3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf123Q5XPI3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf123Q5XPI3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf123Q5XPI3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf123Q5XPI3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf123Q5XPI3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf123Q5XPI3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf123Q5XPI3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf123Q5XPI3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf123Q5XPI3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf123Q5XPI3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf123Q5XPI3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf123Q5XPI3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf123Q5XPI3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf123Q5XPI3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf123Q5XPI3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf123Q5XPI3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf123Q5XPI3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf123Q5XPI3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf123Q5XPI3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf123Q5XPI3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf123Q5XPI3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf123Q5XPI3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf123Q5XPI3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf123Q5XPI3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf123Q5XPI3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf123Q5XPI3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf123Q5XPI3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf123Q5XPI3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf123Q5XPI3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf123Q5XPI3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf123Q5XPI3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf123Q5XPI3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf123Q5XPI3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf123Q5XPI3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf123Q5XPI3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf123Q5XPI3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms