Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWP3

Nacad, NAC-alpha domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NacadQ5SWP3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
NacadQ5SWP3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
NacadQ5SWP3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
NacadQ5SWP3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
NacadQ5SWP3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
NacadQ5SWP3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
NacadQ5SWP3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
NacadQ5SWP3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
NacadQ5SWP3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
NacadQ5SWP3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
NacadQ5SWP3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC37.89■■■■□ 3.66
NacadQ5SWP3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC37.89■■■■□ 3.66
NacadQ5SWP3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC37.89■■■■□ 3.66
NacadQ5SWP3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
NacadQ5SWP3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
NacadQ5SWP3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
NacadQ5SWP3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
NacadQ5SWP3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
NacadQ5SWP3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
NacadQ5SWP3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
NacadQ5SWP3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
NacadQ5SWP3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
NacadQ5SWP3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
NacadQ5SWP3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
NacadQ5SWP3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
NacadQ5SWP3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
NacadQ5SWP3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
NacadQ5SWP3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
NacadQ5SWP3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
NacadQ5SWP3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
NacadQ5SWP3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
NacadQ5SWP3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
NacadQ5SWP3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
NacadQ5SWP3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
NacadQ5SWP3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC37.85■■■■□ 3.65
NacadQ5SWP3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
NacadQ5SWP3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
NacadQ5SWP3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
NacadQ5SWP3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
NacadQ5SWP3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
NacadQ5SWP3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
NacadQ5SWP3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
NacadQ5SWP3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
NacadQ5SWP3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
NacadQ5SWP3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
NacadQ5SWP3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
NacadQ5SWP3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
NacadQ5SWP3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.65
NacadQ5SWP3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
NacadQ5SWP3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
NacadQ5SWP3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.64
NacadQ5SWP3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
NacadQ5SWP3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
NacadQ5SWP3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
NacadQ5SWP3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
NacadQ5SWP3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
NacadQ5SWP3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
NacadQ5SWP3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
NacadQ5SWP3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
NacadQ5SWP3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
NacadQ5SWP3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
NacadQ5SWP3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
NacadQ5SWP3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
NacadQ5SWP3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
NacadQ5SWP3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
NacadQ5SWP3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
NacadQ5SWP3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
NacadQ5SWP3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
NacadQ5SWP3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
NacadQ5SWP3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
NacadQ5SWP3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
NacadQ5SWP3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
NacadQ5SWP3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
NacadQ5SWP3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
NacadQ5SWP3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
NacadQ5SWP3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
NacadQ5SWP3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
NacadQ5SWP3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
NacadQ5SWP3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
NacadQ5SWP3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
NacadQ5SWP3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
NacadQ5SWP3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
NacadQ5SWP3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
NacadQ5SWP3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
NacadQ5SWP3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
NacadQ5SWP3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
NacadQ5SWP3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
NacadQ5SWP3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
NacadQ5SWP3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
NacadQ5SWP3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
NacadQ5SWP3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
NacadQ5SWP3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
NacadQ5SWP3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
NacadQ5SWP3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
NacadQ5SWP3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
NacadQ5SWP3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
NacadQ5SWP3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
NacadQ5SWP3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
NacadQ5SWP3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
NacadQ5SWP3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms