Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW75

Ssh2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh2Q5SW75 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ssh2Q5SW75 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ssh2Q5SW75 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ssh2Q5SW75 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ssh2Q5SW75 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ssh2Q5SW75 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ssh2Q5SW75 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ssh2Q5SW75 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ssh2Q5SW75 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ssh2Q5SW75 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ssh2Q5SW75 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ssh2Q5SW75 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ssh2Q5SW75 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ssh2Q5SW75 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ssh2Q5SW75 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ssh2Q5SW75 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ssh2Q5SW75 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Ssh2Q5SW75 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Ssh2Q5SW75 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ssh2Q5SW75 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ssh2Q5SW75 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ssh2Q5SW75 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ssh2Q5SW75 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ssh2Q5SW75 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ssh2Q5SW75 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ssh2Q5SW75 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Ssh2Q5SW75 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ssh2Q5SW75 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Ssh2Q5SW75 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ssh2Q5SW75 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ssh2Q5SW75 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ssh2Q5SW75 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ssh2Q5SW75 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ssh2Q5SW75 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Ssh2Q5SW75 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ssh2Q5SW75 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ssh2Q5SW75 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ssh2Q5SW75 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ssh2Q5SW75 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ssh2Q5SW75 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ssh2Q5SW75 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ssh2Q5SW75 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ssh2Q5SW75 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ssh2Q5SW75 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ssh2Q5SW75 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ssh2Q5SW75 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ssh2Q5SW75 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ssh2Q5SW75 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ssh2Q5SW75 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ssh2Q5SW75 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ssh2Q5SW75 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ssh2Q5SW75 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ssh2Q5SW75 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ssh2Q5SW75 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ssh2Q5SW75 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ssh2Q5SW75 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ssh2Q5SW75 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ssh2Q5SW75 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ssh2Q5SW75 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ssh2Q5SW75 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ssh2Q5SW75 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ssh2Q5SW75 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ssh2Q5SW75 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ssh2Q5SW75 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ssh2Q5SW75 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ssh2Q5SW75 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ssh2Q5SW75 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Ssh2Q5SW75 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ssh2Q5SW75 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ssh2Q5SW75 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ssh2Q5SW75 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ssh2Q5SW75 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ssh2Q5SW75 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ssh2Q5SW75 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ssh2Q5SW75 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ssh2Q5SW75 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ssh2Q5SW75 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ssh2Q5SW75 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ssh2Q5SW75 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ssh2Q5SW75 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ssh2Q5SW75 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ssh2Q5SW75 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ssh2Q5SW75 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ssh2Q5SW75 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ssh2Q5SW75 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ssh2Q5SW75 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ssh2Q5SW75 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ssh2Q5SW75 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ssh2Q5SW75 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ssh2Q5SW75 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ssh2Q5SW75 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ssh2Q5SW75 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ssh2Q5SW75 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ssh2Q5SW75 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ssh2Q5SW75 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ssh2Q5SW75 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ssh2Q5SW75 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Ssh2Q5SW75 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ssh2Q5SW75 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ssh2Q5SW75 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms