Protein–RNA interactions for Protein: Q5SS91

Sun3, SUN domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sun3Q5SS91 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sun3Q5SS91 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sun3Q5SS91 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sun3Q5SS91 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sun3Q5SS91 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sun3Q5SS91 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sun3Q5SS91 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sun3Q5SS91 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sun3Q5SS91 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sun3Q5SS91 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sun3Q5SS91 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sun3Q5SS91 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sun3Q5SS91 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sun3Q5SS91 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sun3Q5SS91 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sun3Q5SS91 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sun3Q5SS91 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sun3Q5SS91 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sun3Q5SS91 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sun3Q5SS91 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sun3Q5SS91 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sun3Q5SS91 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sun3Q5SS91 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sun3Q5SS91 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sun3Q5SS91 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sun3Q5SS91 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sun3Q5SS91 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sun3Q5SS91 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sun3Q5SS91 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sun3Q5SS91 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sun3Q5SS91 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sun3Q5SS91 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sun3Q5SS91 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sun3Q5SS91 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sun3Q5SS91 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sun3Q5SS91 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sun3Q5SS91 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sun3Q5SS91 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sun3Q5SS91 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sun3Q5SS91 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sun3Q5SS91 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sun3Q5SS91 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sun3Q5SS91 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sun3Q5SS91 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sun3Q5SS91 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sun3Q5SS91 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sun3Q5SS91 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sun3Q5SS91 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sun3Q5SS91 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sun3Q5SS91 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sun3Q5SS91 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sun3Q5SS91 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sun3Q5SS91 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sun3Q5SS91 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sun3Q5SS91 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sun3Q5SS91 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sun3Q5SS91 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sun3Q5SS91 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sun3Q5SS91 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sun3Q5SS91 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sun3Q5SS91 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sun3Q5SS91 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sun3Q5SS91 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sun3Q5SS91 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sun3Q5SS91 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sun3Q5SS91 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sun3Q5SS91 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sun3Q5SS91 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sun3Q5SS91 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sun3Q5SS91 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sun3Q5SS91 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sun3Q5SS91 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sun3Q5SS91 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sun3Q5SS91 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sun3Q5SS91 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sun3Q5SS91 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sun3Q5SS91 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sun3Q5SS91 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sun3Q5SS91 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sun3Q5SS91 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sun3Q5SS91 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sun3Q5SS91 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sun3Q5SS91 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sun3Q5SS91 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sun3Q5SS91 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sun3Q5SS91 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sun3Q5SS91 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sun3Q5SS91 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sun3Q5SS91 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sun3Q5SS91 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sun3Q5SS91 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sun3Q5SS91 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sun3Q5SS91 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sun3Q5SS91 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sun3Q5SS91 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sun3Q5SS91 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sun3Q5SS91 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sun3Q5SS91 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sun3Q5SS91 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sun3Q5SS91 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms