Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf12Q5SPL2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf12Q5SPL2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf12Q5SPL2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf12Q5SPL2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf12Q5SPL2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf12Q5SPL2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf12Q5SPL2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf12Q5SPL2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf12Q5SPL2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf12Q5SPL2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf12Q5SPL2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf12Q5SPL2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf12Q5SPL2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf12Q5SPL2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf12Q5SPL2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf12Q5SPL2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf12Q5SPL2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf12Q5SPL2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf12Q5SPL2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf12Q5SPL2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf12Q5SPL2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf12Q5SPL2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf12Q5SPL2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf12Q5SPL2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf12Q5SPL2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf12Q5SPL2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf12Q5SPL2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf12Q5SPL2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf12Q5SPL2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf12Q5SPL2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf12Q5SPL2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf12Q5SPL2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf12Q5SPL2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf12Q5SPL2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf12Q5SPL2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf12Q5SPL2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf12Q5SPL2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf12Q5SPL2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf12Q5SPL2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf12Q5SPL2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf12Q5SPL2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf12Q5SPL2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf12Q5SPL2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf12Q5SPL2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf12Q5SPL2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf12Q5SPL2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf12Q5SPL2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Phf12Q5SPL2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Phf12Q5SPL2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Phf12Q5SPL2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Phf12Q5SPL2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Phf12Q5SPL2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf12Q5SPL2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms