Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtp3Q5QGU6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms