Protein–RNA interactions for Protein: Q5M8N4

Sdr39u1, Epimerase family protein SDR39U1, mousemouse

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr39u1Q5M8N4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sdr39u1Q5M8N4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr39u1Q5M8N4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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