Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2f8Q58FA4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2f8Q58FA4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2f8Q58FA4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2f8Q58FA4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2f8Q58FA4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2f8Q58FA4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2f8Q58FA4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2f8Q58FA4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2f8Q58FA4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2f8Q58FA4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2f8Q58FA4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2f8Q58FA4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2f8Q58FA4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2f8Q58FA4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2f8Q58FA4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2f8Q58FA4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2f8Q58FA4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2f8Q58FA4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2f8Q58FA4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2f8Q58FA4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2f8Q58FA4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2f8Q58FA4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2f8Q58FA4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2f8Q58FA4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2f8Q58FA4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2f8Q58FA4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2f8Q58FA4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2f8Q58FA4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2f8Q58FA4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2f8Q58FA4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2f8Q58FA4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2f8Q58FA4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2f8Q58FA4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2f8Q58FA4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2f8Q58FA4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2f8Q58FA4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
E2f8Q58FA4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2f8Q58FA4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2f8Q58FA4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2f8Q58FA4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2f8Q58FA4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2f8Q58FA4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2f8Q58FA4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
E2f8Q58FA4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2f8Q58FA4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2f8Q58FA4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2f8Q58FA4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
E2f8Q58FA4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
E2f8Q58FA4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2f8Q58FA4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2f8Q58FA4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2f8Q58FA4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2f8Q58FA4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2f8Q58FA4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2f8Q58FA4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2f8Q58FA4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2f8Q58FA4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2f8Q58FA4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2f8Q58FA4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2f8Q58FA4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2f8Q58FA4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2f8Q58FA4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2f8Q58FA4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2f8Q58FA4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2f8Q58FA4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2f8Q58FA4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2f8Q58FA4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2f8Q58FA4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2f8Q58FA4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2f8Q58FA4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2f8Q58FA4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2f8Q58FA4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2f8Q58FA4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2f8Q58FA4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2f8Q58FA4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2f8Q58FA4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2f8Q58FA4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2f8Q58FA4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2f8Q58FA4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2f8Q58FA4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
E2f8Q58FA4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2f8Q58FA4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2f8Q58FA4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2f8Q58FA4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2f8Q58FA4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2f8Q58FA4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2f8Q58FA4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
E2f8Q58FA4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
E2f8Q58FA4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2f8Q58FA4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2f8Q58FA4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2f8Q58FA4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2f8Q58FA4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
E2f8Q58FA4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2f8Q58FA4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2f8Q58FA4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2f8Q58FA4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2f8Q58FA4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2f8Q58FA4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms