Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
E330034G19RikQ3UWX6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
E330034G19RikQ3UWX6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E330034G19RikQ3UWX6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E330034G19RikQ3UWX6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E330034G19RikQ3UWX6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E330034G19RikQ3UWX6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E330034G19RikQ3UWX6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E330034G19RikQ3UWX6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E330034G19RikQ3UWX6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E330034G19RikQ3UWX6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E330034G19RikQ3UWX6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E330034G19RikQ3UWX6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E330034G19RikQ3UWX6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E330034G19RikQ3UWX6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E330034G19RikQ3UWX6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
E330034G19RikQ3UWX6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
E330034G19RikQ3UWX6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
E330034G19RikQ3UWX6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
E330034G19RikQ3UWX6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
E330034G19RikQ3UWX6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
E330034G19RikQ3UWX6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
E330034G19RikQ3UWX6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
E330034G19RikQ3UWX6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
E330034G19RikQ3UWX6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
E330034G19RikQ3UWX6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
E330034G19RikQ3UWX6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
E330034G19RikQ3UWX6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
E330034G19RikQ3UWX6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
E330034G19RikQ3UWX6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E330034G19RikQ3UWX6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms