Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm28047Q3US59 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm28047Q3US59 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm28047Q3US59 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm28047Q3US59 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm28047Q3US59 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm28047Q3US59 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm28047Q3US59 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm28047Q3US59 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm28047Q3US59 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm28047Q3US59 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm28047Q3US59 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm28047Q3US59 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm28047Q3US59 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm28047Q3US59 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm28047Q3US59 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm28047Q3US59 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm28047Q3US59 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm28047Q3US59 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm28047Q3US59 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm28047Q3US59 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm28047Q3US59 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm28047Q3US59 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm28047Q3US59 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm28047Q3US59 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm28047Q3US59 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm28047Q3US59 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm28047Q3US59 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm28047Q3US59 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm28047Q3US59 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm28047Q3US59 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm28047Q3US59 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm28047Q3US59 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm28047Q3US59 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm28047Q3US59 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm28047Q3US59 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm28047Q3US59 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm28047Q3US59 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm28047Q3US59 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm28047Q3US59 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm28047Q3US59 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm28047Q3US59 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm28047Q3US59 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm28047Q3US59 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm28047Q3US59 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm28047Q3US59 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm28047Q3US59 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm28047Q3US59 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm28047Q3US59 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm28047Q3US59 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm28047Q3US59 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm28047Q3US59 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm28047Q3US59 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm28047Q3US59 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm28047Q3US59 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm28047Q3US59 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm28047Q3US59 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm28047Q3US59 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm28047Q3US59 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm28047Q3US59 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm28047Q3US59 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm28047Q3US59 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm28047Q3US59 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm28047Q3US59 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm28047Q3US59 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm28047Q3US59 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm28047Q3US59 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm28047Q3US59 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm28047Q3US59 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm28047Q3US59 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm28047Q3US59 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm28047Q3US59 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm28047Q3US59 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm28047Q3US59 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm28047Q3US59 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm28047Q3US59 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm28047Q3US59 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm28047Q3US59 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm28047Q3US59 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm28047Q3US59 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm28047Q3US59 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm28047Q3US59 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm28047Q3US59 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm28047Q3US59 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm28047Q3US59 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm28047Q3US59 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm28047Q3US59 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm28047Q3US59 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm28047Q3US59 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm28047Q3US59 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm28047Q3US59 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm28047Q3US59 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm28047Q3US59 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm28047Q3US59 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm28047Q3US59 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm28047Q3US59 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm28047Q3US59 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm28047Q3US59 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm28047Q3US59 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm28047Q3US59 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms