Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TceancQ3US16 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TceancQ3US16 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms