Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc177Q3UHB8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms