Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtpbp6Q3U6U5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtpbp6Q3U6U5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtpbp6Q3U6U5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtpbp6Q3U6U5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtpbp6Q3U6U5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtpbp6Q3U6U5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtpbp6Q3U6U5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtpbp6Q3U6U5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtpbp6Q3U6U5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtpbp6Q3U6U5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtpbp6Q3U6U5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtpbp6Q3U6U5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtpbp6Q3U6U5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtpbp6Q3U6U5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtpbp6Q3U6U5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtpbp6Q3U6U5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtpbp6Q3U6U5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtpbp6Q3U6U5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gtpbp6Q3U6U5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Gtpbp6Q3U6U5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gtpbp6Q3U6U5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtpbp6Q3U6U5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtpbp6Q3U6U5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtpbp6Q3U6U5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtpbp6Q3U6U5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtpbp6Q3U6U5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtpbp6Q3U6U5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtpbp6Q3U6U5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtpbp6Q3U6U5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtpbp6Q3U6U5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtpbp6Q3U6U5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtpbp6Q3U6U5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtpbp6Q3U6U5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtpbp6Q3U6U5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtpbp6Q3U6U5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtpbp6Q3U6U5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtpbp6Q3U6U5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtpbp6Q3U6U5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtpbp6Q3U6U5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtpbp6Q3U6U5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtpbp6Q3U6U5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtpbp6Q3U6U5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gtpbp6Q3U6U5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gtpbp6Q3U6U5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gtpbp6Q3U6U5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Gtpbp6Q3U6U5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gtpbp6Q3U6U5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gtpbp6Q3U6U5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gtpbp6Q3U6U5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gtpbp6Q3U6U5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtpbp6Q3U6U5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtpbp6Q3U6U5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtpbp6Q3U6U5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtpbp6Q3U6U5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtpbp6Q3U6U5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtpbp6Q3U6U5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtpbp6Q3U6U5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtpbp6Q3U6U5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtpbp6Q3U6U5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtpbp6Q3U6U5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtpbp6Q3U6U5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtpbp6Q3U6U5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtpbp6Q3U6U5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtpbp6Q3U6U5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtpbp6Q3U6U5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtpbp6Q3U6U5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtpbp6Q3U6U5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtpbp6Q3U6U5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtpbp6Q3U6U5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtpbp6Q3U6U5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtpbp6Q3U6U5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtpbp6Q3U6U5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtpbp6Q3U6U5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtpbp6Q3U6U5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtpbp6Q3U6U5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtpbp6Q3U6U5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtpbp6Q3U6U5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtpbp6Q3U6U5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtpbp6Q3U6U5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtpbp6Q3U6U5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtpbp6Q3U6U5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtpbp6Q3U6U5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtpbp6Q3U6U5 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtpbp6Q3U6U5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtpbp6Q3U6U5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtpbp6Q3U6U5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
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