Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V1

Khsrp, Far upstream element-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KhsrpQ3U0V1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KhsrpQ3U0V1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KhsrpQ3U0V1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KhsrpQ3U0V1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KhsrpQ3U0V1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KhsrpQ3U0V1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KhsrpQ3U0V1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KhsrpQ3U0V1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KhsrpQ3U0V1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KhsrpQ3U0V1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KhsrpQ3U0V1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KhsrpQ3U0V1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KhsrpQ3U0V1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KhsrpQ3U0V1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KhsrpQ3U0V1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KhsrpQ3U0V1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KhsrpQ3U0V1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KhsrpQ3U0V1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KhsrpQ3U0V1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KhsrpQ3U0V1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KhsrpQ3U0V1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KhsrpQ3U0V1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KhsrpQ3U0V1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KhsrpQ3U0V1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KhsrpQ3U0V1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KhsrpQ3U0V1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KhsrpQ3U0V1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KhsrpQ3U0V1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KhsrpQ3U0V1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KhsrpQ3U0V1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KhsrpQ3U0V1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KhsrpQ3U0V1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KhsrpQ3U0V1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KhsrpQ3U0V1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KhsrpQ3U0V1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KhsrpQ3U0V1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KhsrpQ3U0V1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KhsrpQ3U0V1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KhsrpQ3U0V1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KhsrpQ3U0V1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KhsrpQ3U0V1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KhsrpQ3U0V1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KhsrpQ3U0V1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KhsrpQ3U0V1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KhsrpQ3U0V1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KhsrpQ3U0V1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KhsrpQ3U0V1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KhsrpQ3U0V1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KhsrpQ3U0V1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KhsrpQ3U0V1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KhsrpQ3U0V1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KhsrpQ3U0V1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KhsrpQ3U0V1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KhsrpQ3U0V1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KhsrpQ3U0V1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KhsrpQ3U0V1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KhsrpQ3U0V1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KhsrpQ3U0V1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KhsrpQ3U0V1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KhsrpQ3U0V1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KhsrpQ3U0V1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KhsrpQ3U0V1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KhsrpQ3U0V1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KhsrpQ3U0V1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KhsrpQ3U0V1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KhsrpQ3U0V1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KhsrpQ3U0V1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KhsrpQ3U0V1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KhsrpQ3U0V1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KhsrpQ3U0V1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KhsrpQ3U0V1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KhsrpQ3U0V1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KhsrpQ3U0V1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KhsrpQ3U0V1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KhsrpQ3U0V1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KhsrpQ3U0V1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
KhsrpQ3U0V1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KhsrpQ3U0V1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KhsrpQ3U0V1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KhsrpQ3U0V1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
KhsrpQ3U0V1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KhsrpQ3U0V1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KhsrpQ3U0V1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KhsrpQ3U0V1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KhsrpQ3U0V1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KhsrpQ3U0V1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KhsrpQ3U0V1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KhsrpQ3U0V1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KhsrpQ3U0V1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KhsrpQ3U0V1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KhsrpQ3U0V1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KhsrpQ3U0V1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KhsrpQ3U0V1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KhsrpQ3U0V1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KhsrpQ3U0V1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KhsrpQ3U0V1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KhsrpQ3U0V1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KhsrpQ3U0V1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KhsrpQ3U0V1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KhsrpQ3U0V1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms