Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX08

Trmt1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt1Q3TX08 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trmt1Q3TX08 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trmt1Q3TX08 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Trmt1Q3TX08 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trmt1Q3TX08 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trmt1Q3TX08 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trmt1Q3TX08 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trmt1Q3TX08 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trmt1Q3TX08 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trmt1Q3TX08 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trmt1Q3TX08 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trmt1Q3TX08 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trmt1Q3TX08 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trmt1Q3TX08 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trmt1Q3TX08 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trmt1Q3TX08 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trmt1Q3TX08 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trmt1Q3TX08 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trmt1Q3TX08 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trmt1Q3TX08 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trmt1Q3TX08 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trmt1Q3TX08 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trmt1Q3TX08 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trmt1Q3TX08 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trmt1Q3TX08 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trmt1Q3TX08 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Trmt1Q3TX08 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trmt1Q3TX08 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trmt1Q3TX08 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trmt1Q3TX08 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trmt1Q3TX08 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trmt1Q3TX08 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trmt1Q3TX08 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trmt1Q3TX08 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trmt1Q3TX08 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trmt1Q3TX08 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trmt1Q3TX08 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trmt1Q3TX08 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trmt1Q3TX08 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trmt1Q3TX08 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trmt1Q3TX08 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trmt1Q3TX08 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trmt1Q3TX08 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trmt1Q3TX08 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trmt1Q3TX08 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trmt1Q3TX08 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trmt1Q3TX08 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trmt1Q3TX08 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trmt1Q3TX08 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trmt1Q3TX08 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Trmt1Q3TX08 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trmt1Q3TX08 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trmt1Q3TX08 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Trmt1Q3TX08 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trmt1Q3TX08 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trmt1Q3TX08 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trmt1Q3TX08 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trmt1Q3TX08 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trmt1Q3TX08 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trmt1Q3TX08 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trmt1Q3TX08 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trmt1Q3TX08 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trmt1Q3TX08 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trmt1Q3TX08 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trmt1Q3TX08 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trmt1Q3TX08 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trmt1Q3TX08 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trmt1Q3TX08 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trmt1Q3TX08 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trmt1Q3TX08 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trmt1Q3TX08 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trmt1Q3TX08 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trmt1Q3TX08 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trmt1Q3TX08 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trmt1Q3TX08 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trmt1Q3TX08 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trmt1Q3TX08 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trmt1Q3TX08 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trmt1Q3TX08 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trmt1Q3TX08 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trmt1Q3TX08 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trmt1Q3TX08 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trmt1Q3TX08 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trmt1Q3TX08 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trmt1Q3TX08 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trmt1Q3TX08 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trmt1Q3TX08 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trmt1Q3TX08 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trmt1Q3TX08 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trmt1Q3TX08 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trmt1Q3TX08 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trmt1Q3TX08 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trmt1Q3TX08 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trmt1Q3TX08 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trmt1Q3TX08 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trmt1Q3TX08 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trmt1Q3TX08 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trmt1Q3TX08 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trmt1Q3TX08 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trmt1Q3TX08 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms